アルコバクター属（Arcobacter）

グラム陰性で、螺旋状または曲線状の形をしています。
水や土壌などの環境中に自然に存在しますが、家畜や野生動物の消化器系にも見られます。
特に家畜由来の食品を通じて人間に感染し、下痢や腹痛などの胃腸炎を引き起こすことが知られています。

細菌の種類一覧

グラム陽性球菌

グラム陽性球菌（GPC：Gram-Positive Cocci）
- ブドウ球菌属（Staphylococcus）
  - 黄色ブドウ球菌（S.aurens）
  - 表皮ブドウ球菌（S.epidermidis）
  - 腐生ブドウ球菌（S.saprophyticus）
- レンサ球菌属（Streptococcus）・・・腸内常在菌。ホモ
  - A群溶血性レンサ球菌（S.pyogenes）・・・溶連菌
  - B群溶血性レンサ球菌（S.agalactiae）
  - C, G群溶血性レンサ球菌（S.dysgalactiae ssp.equisimilis）
  - アンギノサス（S.anginosus）
  - コンステラータス（S.constellatus）
  - インターメディウス（S.intermedius）
  - 肺炎レンサ球菌（S.pneumoniae）・・・呼吸器
  - ミティス（S.mitis）
  - サングイニス（S.sangulnis）
  - サリバリアス（S.salivarius）
  - ウシレンサ球菌（S.bovis）
  - ミュータンス（S.mutans）
  - サーモフィルス菌（S.thermophilus)・・・乳酸菌
  - フェカリス菌（S.faecalis）・・・乳酸菌
- 腸球菌属（Enterococcus）
  - フェカリス菌（E.faecalis)・・・ホモ（乳酸）
  - フェシウム菌（E.faecium)
- ラクトコッカス属 (Lactococcus)
  - ラクトコッカス・ラクティス（L.lactis)・・・ホモ（乳酸）
- ペディオコッカス属(Pediococcus)・・・ホモ（乳酸）
- リューコノストック属 (Leuconostoc)・・・ヘテロ

グラム陽性桿菌

グラム陽性有芽胞（通性）嫌気性桿菌
- バシラスorバチルス属（Bacillus）
  - 炭疽菌（B.anthracis）
  - セレウス菌（B.cereus）
  - ポリファーメンチカス菌（B.polyfermenticus）・・・糖化菌
  - 枯草菌（B.subtilis）・・・糖化菌。ビオフェルミン、ビオスリー
  - 納豆菌（B.natto）・・・糖化菌
  - ジャガイモ菌（B.mesentericus）
グラム陽性有芽胞（偏性）嫌気性桿菌
- クロストリジウム属（Clostridium）・・・腸内常在菌
  - ボツリヌス菌（C.botulinum）
  - ウェルシュ菌（C.perfringens）
  - 破傷風菌（C.tetani）
  - クロストリジウム・デフィシル（C.dificile）・・・菌交代症
  - 酪酸菌（C.butyricum)・・・ミヤBM、ビオスリー
グラム陽性無芽胞（通性）嫌気性桿菌
- コリネバクテリウム属（Corynebacterium）
  - ジフテリア菌（C.diphtheriae）
  - コリネバクテリウム・ジェイケィアム菌（C.jeikeium）
- リステリア属（Listeria）
  - リステリア・モノサイトゲネス（L.monocytogenes）
- ラクトバシラスorラクトバチルス属（Lactobacillus）・・・乳酸菌
  - アシドフィルス菌（L.acidophilus）・・・カルピスのL29乳酸菌、レベニン
  - カゼイ菌（L.casei）・・・ヤクルト菌（シロタ株）
  - ガセリ菌（L.gasseri）・・・雪印のLG乳酸菌
  - デルブリュッキ菌（L.delbrueckii）
  - ラクトバチルス・ブレビス（L.brevis）
  - ラクトバチルス・ヘルベティカス（L.helveticus）
  - ラクトバチルス・ライヒマニ（L.leichmannii）
  - ラクトバチルス・パラカゼイ（L.paracasei）・・・キリンのKW乳酸菌
  - ラクトバチルス・プランタルム（L.plantarum）
  - ラクトバチルス・ラムノサス（L.rhamnosus）
  - ファーメンタム菌（L.fermentum）
  - ブルガリクス菌（L.bulgaricus）・・・明治ブルガリアLB81
  - ロイテリ菌（L.reuteri）
- プロピオニバクテリウム属（Propionibacterium）
- キューティバクテリウム属（Cutibacterium）・・・アクネ菌
グラム陽性無芽胞（偏性）嫌気性桿菌
- ペプトコッカス属（Peptococcus）
  - ペプトストレプトコッカス（Peptostreptococcus）・・・腸内常在菌
- エリジペロスリックス属（Erysipelothrix）
- ルミノコッカス属（Ruminococcus）
- ビフィドバクテリウム属 (Bifidobacterium)・・・腸内常在菌
  - ビフィズス菌類（B.bifidum、B.adolescentis他）・・・ヘテロ（乳酸・酢酸）、ラックビー、ビオフェルミン錠、レベニン、ビオスミン
- ユーバクテリウム属（Eubacterium）・・・腸内常在菌
  - ユーバクテリウム・レクタル（E.rectale）
  - ユーバクテリウム・ハリー（E.hallii）

グラム陰性球菌

グラム陰性球菌（GNC）
- モラクセラ属（Moraxella）
  - モラクセラ・カタラーリス（M.catarrhalis）・・・SHM（呼吸器）
  - モラクセラ・オスロエンシス（M.osloensis）
- ナイセリア属（Neisseria）
  - 髄膜炎菌（N.meningitidis）
  - 淋菌（N.gonorrhoeae）・・・（STD）